Au regard de sa population, Aghione dispose d’un conseil municipal de onze membres. Ceux‑ci sont élus pour six ans au suffrage universel direct par les électeurs inscrits sur la liste électorale de la commune. Le conseil désigne ensuite en son sein le maire et ses adjoints.

Le conseil municipal s'occupe des grandes orientations de la commune (économiques, fiscales, sociales et environnementales ) dans le cadre fixé par la loi et les règlements. C’est lui qui vote les recettes : taux des impôts locaux, tarifs des services communaux, loyers et locations. Il arrête également les dépenses de fonctionnement : salaires, entretien, achats courants, énergie, assurances, festivités, subventions aux associations.

Le conseil est enfin l’instance qui propose et décide en matière d’investissement : travaux d’équipement, études à lancer, projets structurants pour le territoire. Ses choix s’inscrivent dans le court comme dans le long terme, et engagent parfois la commune sur des opérations qui ne se réaliseront que dans trois, cinq ou dix ans.

Le conseil municipal en exercice a été élu lors des dernières élections municipales.